มากิ โกะโต ได้รับเลือกให้เป็นสมาชิกรุ่นที่ 3 ของกลุ่มนักร้องมอร์นิงมุซุเมะ ในปี พ.ศ. 2542 ผลงานในมอร์นิงมุซุเมะชิ้นแรกของเธอคือเพลงซิงเกิล "เลิฟแมชีน" (เพลงซิงเกิลของกลุ่มเพลงแรกที่สร้างยอดขายได้เกิน 1 ล้านชุด)

ระหว่างที่เธอยังเป็นนักร้องของมอร์นิงมุซุเมะ เธอได้เป็นสมาชิกรุ่นก่อตั้งของกลุ่มนักร้องพุคจิโมนิ และเริ่มอาชีพศิลปินเดี่ยวในปี พ.ศ. 2544 ด้วยเพลงซิงเกิล "ไอโนะบะกะยะโร" จนกระทั่งเธอ 'สำเร็จการศึกษา' จากมอร์นิงมุซุเมะ เธอก็ได้ทำหน้าที่เป็นนักร้องนำในหลาย ๆ เพลงของสังกัดเฮลโล! โปรเจกต์

หลังจากที่ 'สำเร็จการศึกษา' แล้ว โกะโตได้ทุ่มเทความสนใจให้กับอาชีพศิลปินเดี่ยวของเธอ และกลุ่มนักร้องระยะสั้นที่เธอเป็นสมาชิก เช่น กลุ่มโกะมัตโต กลุ่มโนะจิอุระนัตสึมิ และกลุ่มเดฟ.ดีวา เป็นต้น และเมื่อเวลาผ่านไป เธอยังเพิ่มความสนใจให้กับการแสดงควบคู่ไปกับการร้องเพลงอีกด้วย

ในช่วงต้นปี พ.ศ. 2550 โกะโตได้รับเลือกให้เป็นสมาชิกของกลุ่มนักร้องพิเศษ "มอร์นิงมุซุเมะ ทันโจ 10 เน็งคิเน็นไต" ที่ก่อตั้งขึ้นมาเพื่อฉลองครบรอบ 10 ปีแห่งการก่อตั้งกลุ่มมอร์นิงมุซุเมะ โดยนอกจากโกะโตแล้ว สมาชิกในกลุ่มดังกล่าวยังประกอบไปด้วยนัตสึมิ อาเบะ คาโอริ อีดะ ริสะ นีงากิ และโคฮารุ คูซูมิ[1] เพลงซิงเกิลของกลุ่มเพลงแรกที่มีชื่อว่า "โบะกุระกะอิกิรุ มายเอเชีย" เปิดตัวครั้งแรกเมื่อวันที่ 24 มกราคม พ.ศ. 2550

วันที่ 28 ตุลาคม 2550 ระหว่างที่เธอกำลังแสดงคอนเสิร์ตรอบสุดท้ายในการทัวร์คอนเสิร์ต "จี-อีโมชันII ~ฮาวทูยูสเซ็กซี~" โกะโตได้ประกาศ 'สำเร็จการศึกษา' จากสังกัดเฮลโล! โปรเจกต์ เพื่อที่จะเข้าทำงานกับสังกัดอื่น ซึ่งต่อมาทางบริษัท อัปฟรอนต์ สังกัดแม่ของเธอและเฮลโล! โปรเจกต์ ได้รายงานว่า สังกัดดังกล่าวคือสังกัดย่อยที่อยู่ในเครือของอัปฟรอนต์แน่นอน[2] การ 'สำเร็จการศึกษา' ของเธอในครั้งนี้ ทำให้เธอไม่สามารถเข้าร่วมการทัวร์คอนเสิร์ตของเฮลโล! โปรเจกต์ ประจำฤดูหนาวของปี พ.ศ. 2551 ได้

และในปัจจุบันนี้มากิ โกะโตได้เซ้นสัญญาเป็นนักร้องภายใต้สังกัดใหม่ริทึม โซนในเครือเอเว็กซ์ แทร็กซ์ ซึ่งเป็นสังกัดเดียวกับคุมิ โคดะอดีตคู่แข่งในการออดิชั่นวงมอร์นิ่ง มุซุเมะ